ВМЕСТЕ К ТАЙНАМ ГЕНЕТИКИ
С 17 по 21 июня в Институте цитологии и генетики СО РАН прошёл Российско-Французский семинар «Геномика, биоинформатика и моделирование в науках о жизни». Основными темами семинара стали компьютерная геномика, предсказание регуляторных последовательностей ДНК, новые технологии анализа генома, применение технологий компьютерного анализа текстов научных публикаций для получения информации о биологических объектах, моделирование развития тканей и органов растений и другие.
Е. Садыкова, «НВС»
Семинар явился платформой для французских и российских ученых в обсуждении широкого круга вопросов из разных областей биоинформатики. Состоялся обмен опытом в решении различных методических задач, обсуждение текущих приоритетов биоинформационных исследований в России, Франции и в мире. И что, наверное, можно считать основным для любого научного мероприятия — учёные получили возможность познакомиться и обрести потенциальных партнеров для проведения совместных научных исследований.
 |
| «Момент истины».
|
Не секрет, что для более успешного решения фундаментальных и прикладных задач биологии необходима интеграция исследователей из разных областей знаний, разных стран, проведение междисциплинарных и международных исследований. Результаты французских и российских учёных в области биоинформатики признаны во всем мире. Наши исследователи выполняют приоритетные работы в области предсказания регуляторных районов ДНК и промоторов, анализа последовательностей и структур ДНК, РНК и белков, анализа генных сетей и их компьютерного моделирования. Французские коллеги из Национального института сельскохозяйственных исследований ведут передовые исследования в области баз данных по геномике растений, повторной аннотации геномов, компьютерного анализа некодирующей ДНК, бактериальной геномике, моделированию структуры белков, генетике животных и системной биологии, компьютерного анализа изображений. Партнёрство российских и французских исследователей в этих областях могло бы обеспечить новые интересные результаты мирового уровня.
 |
| Н.А. Колчанов в кулуарах заседания.
|
Свое мнение о задачах семинара и дальнейшем сотрудничестве высказал академик
Николай Александрович Колчанов, директор ИЦиГ СО РАН:
— Семинар проводится в рамках продолжающегося уже несколько лет сотрудничества между ИЦИГом и INRA (это аналог нашей Академии сельскохозяйственных наук во Франции). В начале у нас были индивидуальные рабочие контакты Елены Артёмовны Салиной по секвенированию генома пшеницы (она сотрудничает с несколькими странами, включая Францию), а также Александра Викторовича Куликова и Нины Константиновны Поповой по физиологической генетике, которые проводились совместно с INRA.
Несколько лет назад мы решили продвигаться к установлению крупномасштабного сотрудничества, и для этого в ИЦиГ была проведена Российско-французская конференция по генетике и биотехнологии растений. Конференция оказалась плодотворной, она была интересна не только ученым, но и всем, кто занимается организацией науки. Поэтому после конференции нами было принято решение съездить во Францию и посетить несколько крупных центров INRA в Тулузе, Лионе и Париже. Поездка состоялась прошлой осенью, и это окончательно убедило всех в том, что у нас есть довольно хорошие возможности для сотрудничества. Французы выбрали для совместных исследований системную биологию — это интеграция высокотехнологичных научных исследований и биоинформатики, позволяющая выявлять значимые характеристики и существенные особенности функционирования живых систем на различных уровнях иерархической организации, от генов и геномов, включая белки клетки, до тканей, органов и организмов.
 |
| Ж.-Ф. Жибра, Париж.
|
Это, собственно говоря, и является целью нашего семинара. В Новосибирск приехали ученые из различных научных центров INRA, и что самое существенное, в семинаре принял участие вице-президент INRA профессор Ги Риба, который до этого посетил несколько городов Сибири и Казахстана, а затем вернулся к нам, чтобы обсудить возможности крупномасштабного сотрудничества в некоторых областях биологии, в частности, в генотипировании растений, значимых для сельского хозяйства. Дело в том, что в России существуют коллекции растений с уникальным генофондом. Исследования в этой области позволили бы выявить гены и генетические особенности на молекулярном уровне, значимые для формирования полезных характеристик растений. Это же касается и генотипирования животных.
 |
| Ф. Родольф, Париж.
|
Ещё одна задача, которую мы обсуждали и также намерены включить в планы совместной работы — это метагеномика, новое направление, занимающееся исследованием геномов сообществ микроорганизмов, обитающих в широком спектре экологических ниш. Это и поля, которые со временем приобретают специфические наборы микроорганизмов, и животные, внутри которых также обитают микроорганизмы, характерные для определенных видов животных и мест их обитания. Понятно, что метагеномика — это важное направление биологии, которое стоит развивать. Ещё одно направление для совместного сотрудничества — компьютерная биология, позволяющая планировать высокопроизводительные эксперименты и интерпретировать их. Таковы задачи нашего семинара и области российско-французского сотрудничества.
Мы также побеседовали с вице-президентом INRA, профессором Ги Риба:
— Бывали ли вы раньше в России, и какова цель визита?
— Я был в России 30 лет назад, нынешний мой приезд — второй по счету, а здесь, в Сибири, я впервые. Цель поездки — проследить, как за это время в вашей стране изменилась ситуация в области науки, сельского хозяйства (особенно селекции зерновых), экологии. И какие исследования ведутся в области климатических изменений.
— Что вас интересует здесь особенно?
— В Новосибирске меня больше всего заинтересовал Институт цитологии и генетики, один из лучших биологических институтов России. Для INRA этот институт интересен тем, что покрывает очень широкий спектр исследований, от фундаментальных до прикладных. Надеюсь, мы будем развивать налаженное ранее сотрудничество.
— Как обстоят дела во Франции с сельским хозяйством, какой процент населения составляют фермеры?
— Во Франции в данное время примерно 600 тысяч фермеров, 50 лет назад было около 2 миллионов. Выращиваются, в основном, зерновые, главная культура — пшеница, которой засеяно 5 миллионов гектаров. С приходом Евросоюза сельское хозяйство стало намного более интенсивным, и это очень негативно повлияло на окружающую среду, экологию. Главная задача сейчас — разрешить эти проблемы, и в этом состоит роль агрономических исследований.
— Насколько во Франции востребованы разработки ученых, и как быстро они внедряются в жизнь?
— Ситуация во многом зависит от того, принесет ли инновация дополнительный доход, в частности, фермерам. Например, когда пестициды, гербициды и прочие химические разработки пришли из науки в сельское хозяйство, они были восприняты на «ура», и внедрены очень быстро, ведь это должно было повысить урожайность и принести больший доход. Экологически направленные инновации имеют меньше успеха.
— Вам понравился наш Городок?
— Я был приятно удивлен, увидев Академгородок. Очень динамичное научное сообщество, одно из лучших в мире, и очень много молодежи, что в России продолжает приятно удивлять. Природа очень красивая, еда — вкусная. И... много комаров!
Фото В. Новикова
стр. 5
|
