БИОИНФОРМАТИКА: ЧТО ДЕЛАТЬ С "ПОРТРЕТОМ" ГЕНОМА ЧЕЛОВЕКА?
Ольга УШАКОВА, "НВС".
В Доме ученых СО РАН в Новосибирском Академгородке с 7 по 11
августа проходила вторая Международная конференция во
биоинформатике регуляции и структуры генома человека. Она собрала
свыше 200 участников из 20 стран мира и различных городов России.
Прибыли ученые из США, Великобритании, Франции, Бельгии,
Германии, Японии, Индии, Израйля, Китая, Италии, Польши, Новой
Зеландии и так далее. Первая конференция состоялась два года
назад и тоже в Академгородке. Это не случайность жизни научного
сообщества, а вполне обоснованная интенсивным развитием новой
науки именно здесь, можно сказать, складывающаяся закономерность.
И состоялась конференция на базе Института цитологии и генетики
также благодаря неистощимой энергии и организаторскому таланту
зам. директора института председателя оргкомитета Н.Колчанова. На
проведение конференции были получены крупные гранты РФФИ и INTAS,
многие участники приехали за счет грантов различных частных
фондов.
В эти семь дней ведущие биоинформатики мира, собравшиеся для
сведения воедино нынешних представлений в новой области науки, не
только обсуждали аудиторные и стендовые доклады, не только вели
вечерние дискуссии, но и знакомились с жизнью сибиряков. Они
побывали на экскурсиях по Академгородку и Новосибирску, в
археологическом и геологическом музеях, в городской картинной
галерее. После завершения научной части небольшая рабочая группа
конференции выехала на несколько дней на Алтай, где ознакомилась
с уникальной природой этого края и, разумеется, продолжила
обсуждение всего, что происходило на конференции.
|
Доктор Кристиан Овертон -- директор Центра биоинформатики
Пенсильванского университета, признанный лидер исследования
генома; человек, много сделавший для укрепления международных
связей США и России. Он ушел из жизни совсем недавно -- 1 июня
2000 года. Отдавая должное его заслугам, биоинформатики посвятили
конференцию памяти доктора К.Овертона.
|
* * *
Едва человечество успело оказаться на пороге нового века и нового
тысячелетия, как на весь мир прозвучало сообщение, что
секвенирован геном человека. Безусловно, оно было подготовлено
бурным развитием самых разных областей наук в ушедшем XX веке.
Секвенирование генома означает большее для людей, чем самое
гениальное открытие или изобретение прошедшего тысячелетия. Оно
открывает пути к постижению самой человеческой природы, и
возможно -- к пониманию смысла разумной жизни, происхождения
человека. Расшифровка генома -- это новое будущее в биологии,
генетике, медицине, сельском хозяйстве, словом, во всех тех
практических областях жизни, которые определяют духовное и
физическое здоровье каждого конкретного человека...
Вполне возможно, что пока только ученые-биоинформатики
основательнее, как теоретически, так и практически, осознают
перспективы и возможности нового научного направления. И
серьезный приоритет в этой области, как не удивительно сие для
сегодняшнего тяжелого времени в российской науке, принадлежит
Сибирскому отделению. Поэтому-то и конференции начались в
Академгородке, потому-то так активно и отозвались на приглашение
десятки ученых со всего мира.
Об этом и напомнил, открывая конференцию, директор Института
цитологии и генетики академик В.Шумный:
-- Сорок лет назад академик М.Лаврентьев, предвосхищая будущее,
пригласил сюда на работу академика А.Ляпунова и математика
И.Полетаева, организорвал Институт цитологии и генетики вопреки
тенденциям того времени. Тогда-то и началась, по сути, в СО РАН
наука биоинформатика... В НГУ А.Ляпунов стал читать лекции о
применении математики в биологии, и был введен курс
математической биологии. Академик Д.Беляев пригласил затем в
институт молодого математика В.Ратнера... Здесь стала
складываться школа матбиологов. Ее развитию, если вспомнить,
способствовали многие ученые -- генетик Н.Тимофеев-Ресовский,
академик Б.Астауров, академик А.Баев, физиолог М.Колпаков и
другие. А сегодня ИЦГ располагает мощной научной школой
биоинформатики, во главе которой появился молодой лидер нового
поколения Н.Колчанов.
... Впрочем, исторический аспект этой науки уже хорошо известен
читателям "НВС", а вот тот факт, что на конференцию прибыли
научные представители различных частных западных фирм, говорит о
том, что не зря все прошедшие годы СО РАН развивало
фундаментальные теоретические исследования в области молекулярной
кибернетики, молекулярной биологии, генетики и различных
сопутствующих науках. Даже сама тематика программы конференции
отчетливо представляет этот теоретический характер:
-- базы данных по регуляторным последовательностям генома и
регуляторным белкам;
-- представление и интеграция данных по регуляции экспрессии
генов, генные сети;
-- базы данных, компьютерный анализ и моделирование
метаболических путей;
-- методы анализа и предсказания активности функциональных
сайтов;
-- предсказание структуры генов, модели транскрипции, сплайсинга
и контроля трансляции;
-- масштабный анализ геномов и функциональная аннотация
нуклеотидных последовательностей;
-- эволюция регуляторных районов генома;
-- особенности структуры белков и структурной геномики, связанные
с регуляцией;
-- связи между биоинформатикой и экспериментом по функциональной
геномике (микропробы/биочипы и другие технологии исследования
генома).
И вот на эту-то тематику, как мухи на мед, и "слетелись" Джим
Фикетт (компания СмитКляйнБичем), Андреа Калифано (ИБМ), Мануэл
Пейч (ГлаксоВелком) и другие. Сами эти люди -- известные
уважаемые ученые, они работают в научных исследовательских
центрах, лабораториях или институтах названных фирм, где ведутся
и теоретические исследования, и разрабатываются компьютеры,
медицинские препараты, косметика, шампуни, средства бытовой
химии. Впрочем, прибыли они не только для того, чтобы выступить с
докладами и узнать здесь что-то новое, но и с полномочиями от
своих фирм. В первые же дни конференции с ИЦГ были заключены
крупные контракты на проведение исследований в области
биоинформатики. Мировой бизнес стремится не отстать от времени,
только теперь уже не в "оборонке", а в фундаментальных научных
исследованиях по биологии.
Словом, становится очень зримо понятным, почему во всем мире
исследования в области биологии, точнее, наук о жизни, по
финансированию превосходят все остальные науки. Речь идет о
перспективах. Судите сами: секвенированный геном -- это пока что
портрет. Можно ли, например, по портрету человека сказать
что-либо конкретное о его характере, месте в жизни, поведении,
здоровье, окружении?
Так и с геномом: научных проблем дальше возникает больше, чем
решено. Понять, как работает геном, чем занято его "население" --
гены, белки, нуклеотиды, ферменты; каким образом оно так стройно
организовано и действует; какими механизмами управляется; отчего
и как это сложное "производство" дает сбои -- вот научные задачи
нового века. А сто тысяч генов -- это не шутка. Сначала все надо
описать, создать базы данных, модели, с которыми экспериментаторы
и начнут самую что ни на есть интересную и важную работу, которая
и выльется, в конечном итоге, если говорить о самом насущном, в
безвредные и более полезные лекарства, в здоровые и вкусные
продукты питания для всего человечества, и вообще, в лучшее
качество жизни.
* * *
Конференция была настолько многомерной и масштабной, что в одной
публикации обо всем невозможно сразу рассказать. Из российских
ученых на ней выступили известные исследователи Л.Киселев,
Е.Коротков, В.Власов, М.Гельфанд, А.Миронов, В.Ратнер и другие.
Обобщить первые впечатления от конференции корреспондент "НВС"
попросил председателя оргкомитета Н.Колчанова:
-- Прежде всего, удалось выявить тенденции развития
биоинформатики в принципе. Далее -- узнать, что и как исследуется
в других странах, какие проекты осуществляются, чем сегодня уже
можно пользоваться исследователям, какие пути "проторены"... Дело
идет к тому, что биоинформатика, как наука, станет просто
половиной всей биологии. И хотелось бы добавить -- если бы все
институты Сибирского отделения активно заинтересовались
информационными технологиями, они смогли бы и улучшить финансовое
положение своих институтов, и найти новые пути развития своих
научных направлений.
Действительно, если теоретические компьютерные исследования,
лежащие, в общем-то, в области чистой математики и информатики,
так вписались в биологию, то уж физико-техническим наукам они,
безусловно, откроют свои горизонты. И не только: на одной из
фотографий читатель видит трех корифеев -- академиков
Л.Сандахчеева, В.Шумного и В.Молодина. Первые два -- уже на
переднем крае информационных технологий, а вот интерес
археолога... над сим стоит задуматься. Будущее всегда создаем мы
сами, нужно только подальше в него заглянуть.
стр.
|