Координаторы: акад. Кнорре Д. Г., член-корр. РАН Жимулев И. Ф.

Исполнители: НИБХ, ИЦиГ, ИАиЭ, ИФП СО РАН

Проводимые исследования связаны с определением универсальных принципов и специфических особенностей в формировании генетической, химической и физической структуры и функциональной организации хромосом животных и растений.

Сконструирован широкий спектр фотоаффинных реагентов для изучения динамики ДНК-белковых взаимодействий в гетерохроматине. На основе оригинального подхода к созданию моделей комплексов аффинных реагентов с активными центрами ферментов с помощью искусственно сближенных реагирующих группировок в составе одной молекулы получены уникальные данные по механизмам фотоаффинной модификации белков и структурам образующихся продуктов. Авторам проекта принадлежит приоритет в синтезе фталоцианиновых производных олигонуклеотидов и в их исследовании как аффинных реагентов для модификации нуклеиновых кислот.

Для описания процесса формирования ДНК-белковых комплексов в системе in vitro создана экспериментальная установка по действию когерентного излучения на биологические объекты на основе мощного Nd—YAG-лазера и его 2-й, 3-й и 4-й оптических гармоник. Завершено создание первого в мире образца быстродействующего спектрометра, позволяющего регистрировать спектры различных биомолекул за миллисекунды. Разработана новая версия программного обеспечения “Photo” для снятия кинетики спектров, в том числе для использования спектрофотометра в качестве регистратора программ.

Проведена идентификация полного набора различных последовательностей ДНК, составляющих гетерохроматиновые районы хромосом дрозофилы и ржи. Изучены различные механизмы контроля недорепликации ДНК в районе интеркалярного гетерохроматина 11А6-9 и начато клонирование ДНК из района ИГХ 19Е1-4. С целью выяснения участия гена SuUR в модификации глубокой инактивации генов, возникающей при эффекте положения, исследованы действие дозово-компенсаторного комплекса, активного при определении пола, и действие различного числа доз гена SuUR. Анализ политенизации последовательностей ДНК из района 11A6-9 Х-хромосомы самок и самцов проведен в разных политенных тканях (cм. рисунок).

Результаты гибридизации in situ клона tena c политенными хромосомами самок и самцов слюнных желез линии Oregon-R. В районе 11А6-9 Х-хромосомы самки сигнал гибридизации выявляется в зоне перетяжки (а), в диске (редко) (б) и в месте разлома (в). В Х-хромосоме самца сигнал всегда в диске (г). Длина масштабной полоски на иллюстрации - 5 мкм. Figure. Results of in situ hybridization of the tena clone in male and female polytene chromosomes of Oregon-R wild type salivary glands. In the region of 11A6-9 female X chro-mosome the signal of hybridization is seen in region of con-striction (а), in the band (seldom) (б) and in the region of break (в). In the male X chromosome the signal is always localized in the band (г). The scale bare represernts 5 micra.

Список основных публикаций

1. Koryakov D. E., Zhimulev I. F., Dimitri P. (2002) Cytogenetic analysis of the third chromosome heterochromatin of Drosophila melanogaster. Genetics 160: 509—517.
2. Makunin I. V., Volkova E. I., Belyaeva E. S., Nabirochkina E. N., Pirrotta V., Zhimulev I. F. (2002). The Drosophila Suppressor of Underreplication protein binds to late-replicating regions of polytene chromosomes. Genetics 160(3): 1023—1034.
3. Semeshin V. F., Andreyeva E. N., Shloma V. V., Saumweber H., Zhimulev I. F. (2002). Immunogold electron microscope localization of proteins in Drosophila polytene chromosomes: applications and limitations of the method. Chromosome Research 10(5): 429—433.
4. Alekseyenko A. A., Demakova O. V., Belyaeva E. S., Makarevich G. F., Kotlikova I. V., Noethiger R., Zhimulev I. F. (2002). Dosage compensation and intercalary heterochromatin in X chromosomes of Drosophila melanogaster. Chromosoma 111: 106—113.
5. Moshkin Yu. M., Belyakin S. N., Rubtsov N. B., Kokoza E. B., Alekseyenko A. A., Volkova E. I., Belyaeva E. S., Makunin I. V., Spierer P., Zhimulev I. F. (2002). Microdissection and sequence analysis of pericentric heterochromatin from the Drosophila melanogaster mutant Suppressor of underreplication. Chromosoma 111: 114—125.
6. Alekseyev P. V., Romanova I. V., Shakirov M. M., Godovikova T. S. p-Azidophenyl phosphate is a photoactivatable phosphorylating reagent and
   p-benzoquinone monoimine precursor. (2001).
   J. Photochem. Photobiol. B. 65/1: 39—46.

Оглавление

Далее