Институт вычислительной математики и математической геофизики СОРАН



Всероссийская конференция по вычислительной математике КВМ-2007


Тезисы докладов


Статистическое моделирование и методы Монте-Карло

Вычисление зависимости электростатических свойств биомолекул от количества соли в растворе методом Монте-Карло

Симонов Н.А., Фенлей М.О.

ИВМиМГ (Новосибирск),
ИМБ ФГУ (Таллахасси,
Флорида,
США)

Рассматривается проблема численного описания влияния растворённых солей на электростатические свойства биомолекул, находящихся в этом растворе. В рамках неявной модели растворителя и находящихся в нём солей эта задача может быть сведена к нахождению функциональной зависимости электростатического потенциала от концентрации соли. В случае нейтрального раствора одновалентной соли эта проблема равносильна вычислению зависимости решения уравнения Пуассона-Больцмана от параметра Дебая-Хюкеля. Для решения этой задачи в линеаризованном случае мы предлагаем использовать алгоритм блуждания по сферам в сочетании с блужданием в подобластях для моделирования точек выхода Брауновского движения на границу, использованием рандомизированной формулы среднего для учёта граничных условий, а также весовых оценок для одновременного вычисления результатов для серии значений концентрации соли.



Ваши комментарии
Обратная связь
[ICT SBRAS]
[Головная страница]
[Конференции]

© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:52:06)