Институт вычислительной математики и математической геофизики СОРАН



Всероссийская конференция по вычислительной математике КВМ-2011


Тезисы докладов


Статистическое моделирование и методы Монте-Карло

Учёт граничных условий при вычислении электростатических свойств макромолекул

Симонов Н.А.

Бейкер Хьюз,
Новосибирский технологический центр (Новосибирск)

Проблема вычисления электростатических свойств макромолекул в растворе рассматривается в рамках неявной модели растворителя и находящихся в нём солей. В такой постановке она требует определения электростатического потенциала во всём трёхмерном пространстве, то есть одновременного решения различных эллиптических уравнений, связанных условиями непрерывности на границах. Для решения поставленной задачи используется алгоритм случайного блуждания по сферам в сочетании с блужданием в подобластях для моделирования точек выхода броуновского движения на границу. При этом граничные условия учитываются при помощи приближённой рандомизации интегральной формулы сферического среднего. В данной работе предлагается новый, более точный алгоритм рандомизации, приводящий к необходимости моделировать ветвящуюся с малой вероятностью марковскую цепь и позволяющий существенно повысить эффективность вычислительного метода.

Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции



Ваши комментарии
Обратная связь
[ICT SBRAS]
[Головная страница]
[Конференции]

© 1996-2000, Институт вычислительных технологий СО РАН, Новосибирск
© 1996-2000, Сибирское отделение Российской академии наук, Новосибирск
    Дата последней модификации: 06-Jul-2012 (11:49:22)