VIII Международная конференция по электронным публикациям "EL-Pub2003"

8 - 10 октября 2003 года, г. Новосибирск, Академгородок,
(номер государственной регистрации 0320301032)

Тезисы докладов

Электронные информационные ресурсы ИТПМ по томографии и биоинформатике: математическое и библиографическое сопровождение

Пикалов В.В.

Институт теоретической и прикладной механики СО РАН (Новосибирск)

В работе излагаются принципы построения развиваемой в ИТПМ СО РАН информационной системы по вычислительной томографии и биоинформатике. В основе системы лежит WЕВ-сервер [1], где в настоящее время проводится интеграция интерактивной библиографической системы по физической томографии с электронными базами данных по двум темам: "Томография газа и плазмы" и "Статистический анализ протеиновых доменов".

В основе системы лежит Web-технология, базирующаяся на языке-интерпретаторе PHP, реляционной базе данных MySQL и распространенном Web-сервере Apache. Система позволяет находить по запросу описание известных алгоритмов вычислительной томографии, получать соответствующие библиографические описания со ссылками на оригиналы работ. Для реализации этих функций в системе предусматривается развитие базы данных на основе СУБД MySQL, языков XML, PHP, JavaScript и Java.

Для раздела сервера по биоинформатике разработана 1-я версия Локальной Базы Данных Протеиновых Доменов (ЛБД ПД или PDDB - Protein Domains Data Base). Пользователю доступен инструментарий по статистическому анализу (расчет корреляций, диаграмм Венна и т.д.) геномов более 100 организмов.

Тестовая версия системы доступна на Web-странице автора данной работы [1]. Пользователю предоставляется Web-интерфейс к библиографической базе данных с возможностью поиска работ с описанием большинства алгоритмов двумерной и трехмерной малоракурсной томографии газа и плазмы (также в этой базе имеется библиография по биоинформатике, обратным задачам, интегральным уравнениям, вэйвлет-анализу, обработке изображений, методам трехмерной визуализации и компьютерной графике).

Объединение библиографической и фактографической баз данных на одном информационном ресурсе позволит существенно продвинуть развитие работ по томографии и биоинформатике. Кроме того, разрабатываемая система послужит и образовательным ресурсом по данной тематике в российском сегменте Интернета.

Дополнительные материалы: HTML
Примечание. Тезисы докладов публикуются в авторской редакции

Ваши комментарии
Обратная связь

[Головная страница]
[Конференции]